Есть предложение выводить в верх либо новый топик либо топик в котором был сделан последний комментарий, как на классических формах это заведено, по поводу уведомлений я бы сделал так что бы приходили только от туда где комментировал или где подписался о том что бы приходили уведомления и один раз в день делать выписку о всех изменениях типа "были созданы такие-то топики и там-то были добавлены Коментарии".