Нужна помощь по установке modx на хостинг для домена второго уровня

Во-первых, вы имеете ввиду домен третьего уровня, скорее всего, типа at.mysite.host
 Во-вторых, этот вопрос не имеет прямого отношения к MODX-у, а имеет отношение непосредственно к хостингу, и лучше этот вопрос своему хостингу и задайте.