Ринат, добрый день!
Может прав нету? Потому что даже на MODX3 работало. Убедитесь, что ваш пользователь отмечен как суперпользователь (а не просто админ, то есть галочка нужна). А если надо не для судо, а для какого-то отдельного, то права надо выставить console (вот в исходном коде). Или попробуйте этот пункт меню отредактировать и убрать требуемые права.