8. Что-то подобное, по-моему, разбирали на modx.pro. Обновите pdoTools до последней версии. И если у вас MySQL-5.7+, то читайте логи на наличие SQL-ошибок, так как эта СУБД более капризная.
Ну и проверьте права на папку core/cache и подобные. Если вы бэкап вручную восстанавливаете, может у веб-сервера нет прав на запись в кэш-папки.