У меня ощущение, что просто не хватает прав на папку. Такое бывает. Права на запись в имеющуюся папку есть (она была установлена с нужными правами), а новая папка создается с лимитированными правами. Вы папку кеша через файловый менеджер MODX-а удалить можете? И смотрите логи php/apache, что там пишется? Да и в логи MODX-а гляньте.