Если это спустя какое-то время происходит, то скорее всего просто не успевает скачать файл из-за ограничений канала на вашем хостинге. Можете скачать файл напрямую: 2.1.0.shopmodxbox.modxdev.webtm.ru/shopmodxbox-2.1.0-beta.transport.zip
Потом сделаю вывод файлов на сайте репозитория.