$where->innerJoin('modTemplateVarResource','TemplateVarResources');
'TemplateVarResources.value:like' => '%valuetest%'
Это вам не надо добавлять. Это общее присоединение TV-полей, и оно итак прописано в getdata-процессоре, если вы его используете. Но это что касается getdata-процессора (рекомендую для выборок использовать именно его).
Но если вы чистый запрос пишите, то да, так и есть.